MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157_Sal

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017903	GTA	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017903	CTTAA	2	10	1588	1597	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017903	GATT	2	8	1614	1621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017903	TCCT	2	8	1738	1745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017903	TAG	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017903	T	6	6	2230	2235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017903	A	7	7	3295	3301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017903	A	6	6	3335	3340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017903	G	7	7	7931	7937	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017903	ATAA	2	8	9962	9969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017903	TAA	2	6	11093	11098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017903	G	8	8	11099	11106	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017903	AAG	2	6	13131	13136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017903	T	7	7	13533	13539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017903	T	8	8	17411	17418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017903	GAAA	2	8	17475	17482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017903	ATT	2	6	17548	17553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017903	AGG	2	6	18987	18992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017903	TGTTA	2	10	19240	19249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017903	ACCCT	2	10	19276	19285	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017903	TG	3	6	19318	19323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017903	T	7	7	19335	19341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017903	CCTT	2	8	19410	19417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017903	ATT	2	6	19434	19439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017903	A	6	6	20851	20856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017903	TAA	2	6	20857	20862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017903	G	7	7	21254	21260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017903	C	6	6	21265	21270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_017903	TAAA	2	8	23139	23146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017903	A	7	7	23144	23150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017903	TTTTA	2	10	23423	23432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017903	GAT	2	6	23499	23504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017903	AGGT	2	8	23508	23515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017903	GAT	2	6	23529	23534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017903	AGG	2	6	23558	23563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017903	CCTT	2	8	23602	23609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017903	ATGCC	2	10	23671	23680	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017903	CAAA	2	8	23752	23759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017903	CAAA	2	8	23763	23770	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017903	A	7	7	23768	23774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017903	T	6	6	24022	24027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017903	AGA	2	6	24054	24059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017903	A	6	6	24061	24066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017903	GCC	2	6	24071	24076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017903	AAAG	2	8	24084	24091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017903	GGTT	2	8	24124	24131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017903	CTT	2	6	24165	24170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017903	TGT	2	6	24191	24196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017903	TGT	2	6	24201	24206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017903	T	9	9	24472	24480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017903	ACCGC	2	10	24487	24496	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_017903	AGCGA	2	10	24519	24528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017903	GAAC	2	8	24530	24537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017903	GAG	2	6	24547	24552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017903	ATA	2	6	24556	24561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017903	AAT	2	6	24568	24573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017903	CCCGC	2	10	24666	24675	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
58	NC_017903	AC	3	6	24680	24685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017903	CCCTG	2	10	24714	24723	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_017903	A	6	6	24730	24735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017903	TA	3	6	28836	28841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017903	ACAA	2	8	28947	28954	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017903	GTG	3	9	28973	28981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017903	AAC	2	6	28993	28998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017903	CAAA	2	8	29024	29031	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017903	A	6	6	29029	29034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017903	TTTA	2	8	30351	30358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017903	CAA	2	6	32264	32269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017903	TTC	2	6	32293	32298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017903	TAT	2	6	33434	33439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017903	ACT	2	6	33462	33467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017903	A	7	7	33483	33489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017903	A	6	6	33912	33917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017903	TAAC	2	8	34117	34124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017903	ATAGT	2	10	34130	34139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017903	GTTT	2	8	34182	34189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017903	AT	3	6	34200	34205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017903	GAGGG	2	10	34220	34229	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017903	A	7	7	34280	34286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017903	AAT	2	6	34311	34316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017903	GCC	2	6	34654	34659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017903	C	8	8	35261	35268	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_017903	T	6	6	35274	35279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017903	GCT	2	6	35362	35367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017903	TAAGT	2	10	36716	36725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017903	A	6	6	36731	36736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017903	ATA	2	6	36790	36795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017903	GGC	2	6	36842	36847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017903	T	8	8	36848	36855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017903	CCT	2	6	36881	36886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017903	AACG	2	8	37119	37126	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017903	TAT	2	6	37143	37148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017903	T	6	6	37169	37174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017903	TCTT	2	8	37203	37210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017903	TTCCT	2	10	37212	37221	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017903	ACCA	2	8	37281	37288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017903	AACC	2	8	37302	37309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017903	ATG	2	6	37429	37434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017903	A	6	6	37510	37515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017903	CTA	2	6	37587	37592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017903	AGGG	2	8	37770	37777	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.